Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snrpd1P62315 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snrpd1P62315 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snrpd1P62315 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snrpd1P62315 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snrpd1P62315 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd1P62315 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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