Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpfP62307 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpfP62307 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms