Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms