Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ActbP60710 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ActbP60710 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ActbP60710 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ActbP60710 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ActbP60710 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms