Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp1P60335 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp1P60335 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms