Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hps5P59438 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms