Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdhd1P59328 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdhd1P59328 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdhd1P59328 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdhd1P59328 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdhd1P59328 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms