Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdrg1P59048 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms