Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl3P58873 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms