Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samsn1P57725 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samsn1P57725 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms