Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms