Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace1P56818 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms