Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TdgP56581 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms