Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1bbP56400 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms