Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CartptP56388 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CartptP56388 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CartptP56388 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms