Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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