Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms