Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacnb3P54285 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms