Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn1P54254 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms