Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PctpP53808 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PctpP53808 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PctpP53808 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms