Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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