Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp10P52479 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp10P52479 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms