Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Aff3P51827 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aff3P51827 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms