Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FmodP50608 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FmodP50608 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms