Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SftpdP50404 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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