Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cav1P49817 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cav1P49817 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms