Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms