Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms