Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcd1P48410 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms