Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax9P47242 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax9P47242 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax9P47242 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms