Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc2P43407 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms