Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ItgavP43406 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms