Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlx1P43345 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlx1P43345 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms