Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtlP38585 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtlP38585 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtlP38585 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms