Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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