Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpargP37238 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpargP37238 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpargP37238 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms