Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn1P35821 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms