Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddit3P35639 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms