Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms