Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pola2P33611 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pola2P33611 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pola2P33611 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pola2P33611 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pola2P33611 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms