Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd1P33215 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms