Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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