Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfbP31240 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfbP31240 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfbP31240 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfbP31240 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfbP31240 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfbP31240 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfbP31240 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfbP31240 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfbP31240 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfbP31240 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfbP31240 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms