Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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