Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gja4P28235 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gja4P28235 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja4P28235 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja4P28235 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms