Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb3P28231 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb3P28231 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms