Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms