Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms