Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms