Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RdxP26043 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RdxP26043 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RdxP26043 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RdxP26043 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RdxP26043 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms